外三科为普通外科，现为广东省中医药管理局重点专科建设单位。目前有主任医师7人，副主任医师4人，硕士研究生导师1人，有高层次的人才梯队和较强的科研力量。现分为肝胆胰、胃肠、乳腺及甲状腺三个病区。
肝胆胰病区（外三1区）：开展腹腔镜胰十二指肠切除，腹腔镜保脾、保功能胰腺病变手术，重症胰腺炎并发症外科干预、腔镜超声联合荧光腹腔镜肝切除、肝门部胆管癌根治术、肝癌综合治疗、门脉高压治疗、三镜联合（腹腔镜、十二指肠镜、胆道镜）微创治疗胆道结石，经皮经肝胆道镜下碎石、取石、胆道球囊球囊扩张等，中西医治疗手段相结合，已形成具有特色的现代微创专科。
胃肠病区（外三2区）:常规开展各类胃肠、疝外科微创手术：腹腔镜胃肠癌根治术、超低位直肠癌保肛手术、腹腔镜胃肠良性肿瘤切除、腹腔镜复杂肠粘连松解、经肛微创术式等；同时开展各类腹壁疝、胃食管反流及食管裂孔疝微创修复手术。专科特色突出单孔腹腔镜胃肠疝手术、结直肠癌NOSES手术，全程贯彻快速康复外科（ERAS）理念，以微创、低创伤、快恢复为诊疗优势。
乳腺、甲状腺病区（外三3区）:乳腺专科为广东省中医重点专科，开展乳腺肿物的微创治疗，乳腺癌保乳手术及乳腺癌术后一期即刻重建等手术，实行乳腺癌术前新辅助治疗、化疗、靶向、免疫治疗等的一体化全程管理综合治疗。开展甲状腺癌根治术、甲状腺肿物射频消融术，甲状腺腔镜手术，体现了微创美容特色。
