黄智峰教授的临床辨治体系，扎根于岭南本土，升华于国医名师，是传统家学与国家级名老中医经验的完美交融。其流派渊源主要体现在以下两大脉络：
其一，香山家学传承，奠定辨证底色。黄教授的祖父黄少轩是中山地区德高望重的老中医，其父亦在医学领域颇有建树。黄教授自幼耳濡目染，系统继承了祖父及父辈的临证智慧。黄老前辈在面对复杂疑难杂病时，极度重视患者的“先天禀赋”（即体质差异）与“后天脾胃”，并强调治病必须先理顺人体的气机与血脉。这份“杂病辨禀赋为要，调气血为先”的家学底蕴，让黄教授在日后面对男科各种沉疴痼疾时，始终能保持清醒的整体观，不被局部的表象所迷惑。
其二，师承全国名中医，深研男科精髓。在专业深造期间，黄教授拜入崔学教教授门下。崔老是中医治疗岭南地区前列腺炎、前列腺增生、泌尿系结石及男性不育等领域的开拓者。在长期的跟诊抄方中，黄教授不仅继承了崔老一系列效如桴鼓的经验名方（如崔氏槐苓利湿方等），更深刻领悟了崔老将中医宏观辨证与男科局部腺体、经络相结合的诊疗思路。结合其自身在国内外顶尖西医中心学到的现代微创解剖学知识，黄教授将传统中医的理法方药与现代泌尿外科精准结合，最终形成了独树一帜的中西医结合男科学术流派。
